Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5624F6ZZG8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5624F6ZZG8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5624F6ZZG8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5624F6ZZG8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5624F6ZZG8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5624F6ZZG8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5624F6ZZG8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5624F6ZZG8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5624F6ZZG8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5624F6ZZG8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5624F6ZZG8 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5624F6ZZG8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5624F6ZZG8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5624F6ZZG8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5624F6ZZG8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5624F6ZZG8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5624F6ZZG8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5624F6ZZG8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms