Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm3250E9Q1M3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm3250E9Q1M3 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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