Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc170D3YXL0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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