Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rfx8D3YU81 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms