Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11bB4XVQ1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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