Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Phf11cB4XVP9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms