Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Odf2A3KGV1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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