Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp8b5A3FIN4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atp8b5A3FIN4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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