Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtf1A2AQ19 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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