Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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