Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc2Q9Z2H7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gipc2Q9Z2H7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gipc2Q9Z2H7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 272 ms