Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uso1Q9Z1Z0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uso1Q9Z1Z0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uso1Q9Z1Z0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uso1Q9Z1Z0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Uso1Q9Z1Z0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uso1Q9Z1Z0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms