Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W8

Atp12a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp12aQ9Z1W8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp12aQ9Z1W8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp12aQ9Z1W8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp12aQ9Z1W8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp12aQ9Z1W8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.7 ms