Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ddx39bQ9Z1N5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddx39bQ9Z1N5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddx39bQ9Z1N5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms