Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L4

Rs1, Retinoschisin, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rs1Q9Z1L4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rs1Q9Z1L4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rs1Q9Z1L4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rs1Q9Z1L4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms