Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1K5

Arih1, E3 ubiquitin-protein ligase ARIH1, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arih1Q9Z1K5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arih1Q9Z1K5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Arih1Q9Z1K5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arih1Q9Z1K5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arih1Q9Z1K5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Arih1Q9Z1K5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Arih1Q9Z1K5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arih1Q9Z1K5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arih1Q9Z1K5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arih1Q9Z1K5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arih1Q9Z1K5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arih1Q9Z1K5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arih1Q9Z1K5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arih1Q9Z1K5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arih1Q9Z1K5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arih1Q9Z1K5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arih1Q9Z1K5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arih1Q9Z1K5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arih1Q9Z1K5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arih1Q9Z1K5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arih1Q9Z1K5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Arih1Q9Z1K5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arih1Q9Z1K5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arih1Q9Z1K5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arih1Q9Z1K5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms