Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl8Q9Z121 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl8Q9Z121 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl8Q9Z121 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187 ms