Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NgfrQ9Z0W1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NgfrQ9Z0W1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NgfrQ9Z0W1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms