Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gipc1Q9Z0G0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gipc1Q9Z0G0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gipc1Q9Z0G0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms