Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp2Q9Z0E6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbp2Q9Z0E6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp2Q9Z0E6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp2Q9Z0E6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms