Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx1Q9WV80 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx1Q9WV80 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx1Q9WV80 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms