Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnip1Q9WUU8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnip1Q9WUU8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnip1Q9WUU8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnip1Q9WUU8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms