Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClcnkbQ9WUB6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClcnkbQ9WUB6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClcnkbQ9WUB6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClcnkbQ9WUB6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ClcnkbQ9WUB6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ClcnkbQ9WUB6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClcnkbQ9WUB6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms