Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul1Q9WTX6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cul1Q9WTX6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul1Q9WTX6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms