Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PplQ9R269 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PplQ9R269 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PplQ9R269 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PplQ9R269 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
PplQ9R269 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PplQ9R269 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PplQ9R269 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PplQ9R269 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PplQ9R269 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PplQ9R269 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PplQ9R269 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PplQ9R269 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PplQ9R269 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PplQ9R269 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PplQ9R269 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PplQ9R269 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PplQ9R269 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PplQ9R269 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PplQ9R269 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PplQ9R269 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PplQ9R269 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PplQ9R269 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PplQ9R269 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PplQ9R269 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PplQ9R269 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PplQ9R269 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PplQ9R269 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PplQ9R269 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PplQ9R269 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PplQ9R269 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PplQ9R269 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PplQ9R269 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PplQ9R269 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PplQ9R269 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PplQ9R269 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PplQ9R269 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PplQ9R269 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PplQ9R269 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PplQ9R269 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PplQ9R269 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms