Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc2Q9R244 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc2Q9R244 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc2Q9R244 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms