Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NbnQ9R207 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NbnQ9R207 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NbnQ9R207 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms