Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfwd2Q9R1A8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfwd2Q9R1A8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rfwd2Q9R1A8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfwd2Q9R1A8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms