Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plod3Q9R0E1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Plod3Q9R0E1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plod3Q9R0E1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Plod3Q9R0E1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms