Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ripk3Q9QZL0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ripk3Q9QZL0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ripk3Q9QZL0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms