Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Copg1Q9QZE5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copg1Q9QZE5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms