Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim44Q9QXA7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim44Q9QXA7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim44Q9QXA7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms