Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptf1aQ9QX98 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptf1aQ9QX98 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptf1aQ9QX98 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptf1aQ9QX98 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptf1aQ9QX98 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptf1aQ9QX98 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptf1aQ9QX98 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptf1aQ9QX98 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptf1aQ9QX98 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptf1aQ9QX98 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ptf1aQ9QX98 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ptf1aQ9QX98 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ptf1aQ9QX98 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms