Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chaf1aQ9QWF0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chaf1aQ9QWF0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chaf1aQ9QWF0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms