Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr4Q9QUK6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr4Q9QUK6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms