Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul3Q9JLV5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul3Q9JLV5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul3Q9JLV5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul3Q9JLV5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms