Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trpc4apQ9JLV2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc4apQ9JLV2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc4apQ9JLV2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms