Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL16

Isg20, Interferon-stimulated gene 20 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isg20Q9JL16 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Isg20Q9JL16 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Isg20Q9JL16 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Isg20Q9JL16 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Isg20Q9JL16 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Isg20Q9JL16 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Isg20Q9JL16 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Isg20Q9JL16 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Isg20Q9JL16 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Isg20Q9JL16 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms