Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot9Q9JKY0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms