Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Habp4Q9JKS5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Habp4Q9JKS5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Habp4Q9JKS5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Habp4Q9JKS5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Habp4Q9JKS5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Habp4Q9JKS5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Habp4Q9JKS5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Habp4Q9JKS5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Habp4Q9JKS5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Habp4Q9JKS5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Habp4Q9JKS5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Habp4Q9JKS5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Habp4Q9JKS5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms