Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx5Q9JKQ4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx5Q9JKQ4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx5Q9JKQ4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms