Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trem1Q9JKE2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trem1Q9JKE2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trem1Q9JKE2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trem1Q9JKE2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms