Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scamp5Q9JKD3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp5Q9JKD3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp5Q9JKD3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms