Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms