Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htr3bQ9JHJ5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htr3bQ9JHJ5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htr3bQ9JHJ5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms