Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn12Q9ET43 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn12Q9ET43 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn12Q9ET43 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms