Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aff4Q9ESC8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Aff4Q9ESC8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Aff4Q9ESC8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Aff4Q9ESC8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Aff4Q9ESC8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Aff4Q9ESC8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aff4Q9ESC8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms