Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trhr2Q9ERT2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trhr2Q9ERT2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trhr2Q9ERT2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trhr2Q9ERT2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trhr2Q9ERT2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trhr2Q9ERT2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trhr2Q9ERT2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trhr2Q9ERT2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trhr2Q9ERT2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trhr2Q9ERT2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms