Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rpgrip1Q9EPQ2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms