Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnft1Q9DCN7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rnft1Q9DCN7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnft1Q9DCN7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnft1Q9DCN7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms